Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHTF18Q8WVB6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHTF18Q8WVB6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms