Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTR4

GDPD5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD5Q8WTR4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GDPD5Q8WTR4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GDPD5Q8WTR4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GDPD5Q8WTR4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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