Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF40

FNIP1, Folliculin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNIP1Q8TF40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNIP1Q8TF40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FNIP1Q8TF40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FNIP1Q8TF40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms