Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM71BQ8TC56 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM71BQ8TC56 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms