Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LMO3Q8TAP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO3Q8TAP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMO3Q8TAP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms