Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA4Q8NEY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms