Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN19Q8N6F1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN19Q8N6F1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN19Q8N6F1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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