Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOT2Q8IXI1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT2Q8IXI1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT2Q8IXI1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms