Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HERC6Q8IVU3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HERC6Q8IVU3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms