Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP54Q7Z3B4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUP54Q7Z3B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP54Q7Z3B4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms