Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2AFVQ71UI9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2AFVQ71UI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H2AFVQ71UI9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2AFVQ71UI9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms