Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFX8Q6ZV50 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFX8Q6ZV50 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFX8Q6ZV50 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms