Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMD7Q6ZUT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD7Q6ZUT3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FRMD7Q6ZUT3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FRMD7Q6ZUT3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms