Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP1R3FQ6ZSY5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R3FQ6ZSY5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms