Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCARA5Q6ZMJ2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCARA5Q6ZMJ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCARA5Q6ZMJ2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCARA5Q6ZMJ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms