Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP12Q6UXS9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CASP12Q6UXS9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP12Q6UXS9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms