Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SAMD1Q6SPF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SAMD1Q6SPF0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms