Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8BQ6P9F7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8BQ6P9F7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.9 ms