Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRGCQ6NXR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRGCQ6NXR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRGCQ6NXR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms