Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIST2H2AA3Q6FI13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST2H2AA3Q6FI13 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST2H2AA3Q6FI13 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST2H2AA3Q6FI13 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms