Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REP15Q6BDI9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REP15Q6BDI9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms