Protein–RNA interactions for Protein: Q69YG0

TMEM42, Transmembrane protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM42Q69YG0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM42Q69YG0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM42Q69YG0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms