Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALS2CLQ60I27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALS2CLQ60I27 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms