Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
USPL1Q5W0Q7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USPL1Q5W0Q7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms