Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CARMIL1Q5VZK9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CARMIL1Q5VZK9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CARMIL1Q5VZK9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CARMIL1Q5VZK9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms