Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
CHIC1Q5VXU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
CHIC1Q5VXU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CHIC1Q5VXU3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
CHIC1Q5VXU3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
CHIC1Q5VXU3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms