Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SOGA3Q5TF21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOGA3Q5TF21 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SOGA3Q5TF21 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms