Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SWT1Q5T5J6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SWT1Q5T5J6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SWT1Q5T5J6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.9 ms