Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFYVE27Q5T4F4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZFYVE27Q5T4F4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms