Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCNYL2Q5T2Q4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNYL2Q5T2Q4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms