Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC122Q5T0U0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC122Q5T0U0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC122Q5T0U0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC122Q5T0U0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms