Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf10Q5SRN2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf10Q5SRN2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf10Q5SRN2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms