Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC6Q5RKV6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC6Q5RKV6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 447.5 ms