Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms