Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT1Q5JUK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT1Q5JUK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNT1Q5JUK3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms