Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOM1Q5C9Z4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOM1Q5C9Z4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NOM1Q5C9Z4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOM1Q5C9Z4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms