Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC92Q53HC0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC92Q53HC0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC92Q53HC0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms