Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC23Q53EV4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC23Q53EV4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms