Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LONRF3Q496Y0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LONRF3Q496Y0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF3Q496Y0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms