Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP13-3Q3SY46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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KRTAP13-3Q3SY46 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP13-3Q3SY46 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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