Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LONRF1Q17RB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LONRF1Q17RB8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LONRF1Q17RB8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LONRF1Q17RB8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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