Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA9Q16795 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NDUFA9Q16795 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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NDUFA9Q16795 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFA9Q16795 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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NDUFA9Q16795 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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NDUFA9Q16795 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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NDUFA9Q16795 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFA9Q16795 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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