Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLPPQ16740 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLPPQ16740 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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