Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STX1AQ16623 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STX1AQ16623 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms