Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACKR1Q16570 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACKR1Q16570 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACKR1Q16570 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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