Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HMGN3Q15651 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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