Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNHIT3Q15649 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNHIT3Q15649 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNHIT3Q15649 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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