Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKIV2LQ15477 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKIV2LQ15477 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SKIV2LQ15477 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms