Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KARSQ15046 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KARSQ15046 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KARSQ15046 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KARSQ15046 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KARSQ15046 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KARSQ15046 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KARSQ15046 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KARSQ15046 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KARSQ15046 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KARSQ15046 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KARSQ15046 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KARSQ15046 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
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