Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC3Q15034 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC3Q15034 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC3Q15034 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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