Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPNMBQ14956 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPNMBQ14956 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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